Il Settore Museale di Ateneo dell'Università degli Studi di Urbino, ospita tre prestigiose collezioni mineralogiche (Franchin, Lorenzini, Pegoraro) donate in anni diversi all’Ateneo urbinate. Le collezioni mineralogiche sono di rilevante valore scientifico, didattico ed ostensivo, con più di 4.500 campioni di provenienza italiana ed estera, suddivisi su base sistematica.

Il fondo pergamenaceo dell'Università degli Studi di Urbino Carlo Bo è costituito da oltre 1.400 pergamene contenenti rògiti, atti notarili che vanno dal secolo XIII° al secolo XVIII°; il documento più antico, datato 15 ottobre 1213, è una divisione, fatta da Gentile Brancaleoni e suo fratello Alberigo, delle loro possessioni, mentre il più recente è datato 13 dicembre 1794.

Le tavole anatomiche del corpo umano di Paolo Mascagni. Pisa, 1823

La collezione si compone di numerose riproduzioni audio relative a riunioni, convegni e seminari organizzati periodicamente dal Centro Internazionale di Semiotica e Linguistica di Urbino a partire dal 1969, dedicati a tematiche varie, problematiche o campi di indagine ben definiti.

Andreas Vesalius, De humani corporis fabrica libri septem. - Basileae : per Ioannem Oporinum, 1555, Basilea

La “Fototeca Zampetti” comprende oltre 40.000 fotografie, custodite all’interno di Palazzo Albani, provenienti da differenti fondi: Fratelli Alinari, Gabinetto delle Stampe del Ministero, fotografie a corredo delle tesi della Scuola di Perfezionamento in Storia dell’Arte. La raccolta, con relativa catalogazione delle riproduzioni fotografiche, è lo specchio degli interessi di Pietro Zampetti, Direttore dell’Istituto di Storia dell’Arte e docente a Urbino dagli anni 70 agli 90 del ‘900.

La tradizione della stampa nel ducato e nella città di Urbino

Una ricca raccolta di documenti, inventari, memorie, volumi, opera d'arte, reliquie e fotografie storiche dal XV al XVIII secolo, per ricostruire la storia del complesso monumentale San Girolamo di Urbino, prima convento, poi carcere, oggi biblioteca universitaria.